Amidáza (AMD)
Enzymy:Jsou makromolekulární biologické katalyzátory, většina enzymů jsou proteiny
Amidáza:Katalyzují hydrolýzu různých endogenních a cizích alifatických a aromatických amidů přenosem acylové skupiny na vodu za vzniku volných kyselin a amoniaku. Kyseliny hydroxamové a další organické kyseliny se široce používají jako léčiva, protože jsou součástí růstových faktorů, antibiotik a inhibitorů nádorů. Amidázy lze rozdělit na acylázy typu R a typu S podle stereoselektivity katalyzátoru.
Kromě katalýzy hydrolýzy amidů může amidáza také katalyzovat reakce přenosu acylu v přítomnosti kosubstrátů, jako je hydroxylamin.
Amidázy z různých zdrojů mají různou substrátovou specificitu, některé z nich hydrolyzují pouze aromatické amidy, některé pouze alifatické amidy a některé hydrolyzují α- nebo ω-aminoamidy. Většina aminů má dobrou katalytickou aktivitu pouze pro acyklické nebo jednoduché aromatické amidy, ale u komplexních aromatických látek mají heterocyklické amidy, zejména amidy s orto substituenty, obecně nízkou aktivitu (jen několik enzymů vykazuje lepší katalytické účinky).
Katalytický mechanismus:
| Enzymy | Kód produktu | Kód produktu |
| Enzymový prášek | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | sada 19 amidáz, každá po 50 mg 19 položek * 50 mg / položka nebo jiné množství |
| Screeningová sada (SynKit) | ES-AMD-1900 | sada 19 amidáz, každá po 1 mg 19 položek * 1 mg / položka |
★ Vysoká substrátová specificita.
★ Silná chirální selektivita.
★ Vysoká účinnost konverze.
★ Méně vedlejších produktů.
★ Mírné reakční podmínky.
★ Šetrné k životnímu prostředí.
➢ Screening enzymů by měl být proveden pro specifické substráty kvůli jejich specificitě a měl by být vybrán enzym, který katalyzuje cílový substrát s nejlepším katalytickým účinkem.
➢ Nikdy nepřicházejte do styku s extrémními podmínkami, jako jsou: vysoká teplota, vysoké/nízké pH a organická rozpouštědla s vysokou koncentrací.
➢ Reakční systém by měl obvykle obsahovat substrát, pufrovací roztok (optimální pH reakce enzymu). V reakčním systému pro přenos acylové skupiny by měly být přítomny kosubstráty, jako je hydroxylamin.
➢ AMD by měl být přidán do reakčního systému s optimálním pH a teplotou reakce jako poslední.
➢ Všechny druhy AMD mají různé optimální reakční podmínky, proto by měl být každý z nich dále studován samostatně.
Příklad 1(1):
Hydrolýzní aktivita na různé amidové substráty
| Substrát | Specifická aktivita μmol min-1mg-1 | Substrát | Specifická aktivita μmol min-1mg-1 |
| Acetamid | 3,8 | ο-OH benzamid | 1.4 |
| Propionamid | 3,9 | p-OH benzamid | 1.2 |
| Laktamid | 12,8 | ο-NH2benzamid | 1.0 |
| Butyramid | 11,9 | p-NH2benzamid | 0,8 |
| Isobutyramid | 26.2 | ο-Toluamid | 0,3 |
| Pentanamid | 22,0 | p-Toluamid | 8.1 |
| Hexanamid | 6.4 | Nikotinamid | 1,7 |
| Cyklohexanamid | 19,5 | Isonikotinamid | 1,8 |
| Akrylamid | 10.2 | Pikolinamid | 2.1 |
| Metakrylamid | 3,5 | 3-Fenylpropionamid | 7.6 |
| Prolinamid | 3.4 | Indol-3-acetamid | 1,9 |
| Benzamid | 6,8 |
Reakce byla provedena v 50mM pufrovaném roztoku fosforečnanu sodného o pH 7,5 při 70 °C.
| Amidy | Hydroxylamin | Hydrazin |
| Acetamid | 8.4 | 1.4 |
| Propionamid | 18,4 | 3.0 |
| Isobutyramid | 25,0 | 22,7 |
| Benzamid | 9.2 | 6.1 |
Reakce byla provedena v 50mM pufrovaném roztoku fosforečnanu sodného o pH 7,5 při 70 °C.
Související koncentrace činidel: amidy, 100 mM (benzamid, 10 mM); hydroxylamin a hydrazin, 400 mM; enzym 0,9 μM.
Příklad 2(2):
Příklad 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al. Extremophiles, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR a kol. Procesní biochemie, 2015, 50(8): 1400–1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM a kol. Bioorganic Chemistry, 2017, dostupné online 7.
